一‧模式生物model organisms：
包括：線蟲，大腸桿菌，果蠅，斑馬魚，阿拉伯芥
Pattern formation：
動物：三個軸的方向
前後：anteroposterior axis
背腹：dorsoventral axis
左右：rightleft axis
植物：root-shoot axis：radial pattern of growth
二‧發育：
物種的發育受到多種影響，以下分成兩點討論：positional information and transcription factor
A. positional information：
(1)細胞的反應：cell division / cell migration / cell differentiation / apoptosis
(2)如何接收訊息：利用morphogens或是cell adhesion
a. morphogens：影響一個細胞的命運，分布不均而有不同的效果
分布不均的狀況：1.發生在oocyte or egg precursor
2.在胚胎時期，細胞分泌運送後造成的不均勻
Morphogens與濃度相關，要超過一門檻(閾值)才會產生效果
b. cell adhesion：CAM分子
B. transcription factor：
在胚胎發育中扮演重要的角色，胚胎的發育大致分成四階段，每個階段都受不同的transcription factors影響。
1. organize body axis：軸的分化
2. organize into smaller regions：分節segmentation
3. cell organize to produce body part：develop specific body parts
4. cells themselves change morphology：細胞分化，形成器官
三‧果蠅(Drosophilla)模型：
1. 果蠅的生活史：大約十天
a. fertilized oocyte：
b. blastoderm：有兩個部分
第一：syncytial blastoderm：一系列的細胞分裂(沒有細胞質裂)，產生大量的nuclei。
第二：cellular blastoderm：這些nuclei 排列在細胞膜的周圍，接著被其所包圍，形成許多細胞。
c. gastrulation：出現了胚層，包括了ectoderm , endoderm , mesoderm
d. embryo
e. larva
f. pupa：undergoes metamorphosis
g. adult
2. 果蠅發育與developmental genetics
四個階段：
Phase1：決定生物的axis
與bicoid(morphogen的一種)相關，由卵細胞中的nurse cell分泌，造成asymetrically distribution，其轉譯出來的bicoid protein，有transcription factor的作用
Phase2：segmentation分節(head：3，thoracic：3，abdominal：9)
受到segmentation genes的調控：
Bicoid---gap gene ----pair-rule gene----segment-polarity gene
(一連串活化的過程)
Phase3：segment characteristics：發展出各部位的特徵
Homeotic genes：生物體中一類專門調控生物形體的基因，一但這些基因發生突變，就會使身體的一部分變形。Homeotic genes是一連串的基因，分別控制不同的部外，其排列順序與身體的前後軸順序一致，被稱為colinearity rule。
每種生物都有homeotic gene，其數量及排列能做為演化的證據。
Homeobox：在一段homeotic gene中，能夠轉譯出蛋白質的部分(180 b p)
Phase4：cell differenciation：stem cell
Stem cells的特徵：能夠分裂，其子代細胞至少能分化出一種以上的細胞
Totipotent：能形成個體，分化出各種細胞：fertilized egg
Pluripotent：能分化出各種細胞，但不能形成單一個體：胚胎幹細胞
Multipotent：能分化出許多種細胞：hematopoietic stem cell
Unipotent：只能分化出一種細胞：testis分化成sperm
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