組織學-1-2 cytology
一‧plasma membrane (PM)
(1) 流體鑲嵌模型 Fluid mosaic model
(2) PM主要的成份是phospholipid，有親水性頭部與兩條疏水性尾部；頭部有許多不同的結構(PC PS PI PE)，有不同的功能
(3) PM中有許多cholesterol，像墊板般插入膜中，能增加膜的穩固性
(4) 膜蛋白：可以分成integral(穿膜蛋白)，peripheral(以非共價鍵附著在膜上)
→功能：channel，載體，訊號傳遞，還有很多很多
(5) 物質通過細胞膜的機制
→小分子：擴散，facilitated diffusion，active transport(詳見生理)
→小分子：擴散，facilitated diffusion，active transport(詳見生理)
→大分子：進行endocytosis與exocytosis
a. endocytosis：分成pinocytosis，phagocytosis，receptor-mediated endocytosis
→pinocytosis：胞飲，膜凹陷，將液體分子包入細胞中
→phagocytosis：胞噬：最常見的例子是macrophage伸出偽足吞細菌
→RME：膜上受器接收分子後，會促進coated pit的形成(clathrin，adaptin)
接著會往細胞內凹陷形成coated vesicle，最後clathrin等蛋白質脫離，形成uncoated vesicele
b. exocytosis：需要一些特殊蛋白質的協助(v-SNARE，t-SNARE)
→依照其分泌是否受調控分為constitutive，regulated兩種
c. hypercholesterolemia高膽固醇血症
→LDL分子乃利用RME機制進入細胞中
→然而，要是膜上缺乏receptor，LDL無法進入cell，因此堆積在血液
二‧cytoplasm
(1) cytoplasm：cytosol + organelles +inclusions
cytosol：細胞內的jelly like溶液
(2) ER內質網：依照是否附著ribosome分為RER，SER
RER：蛋白質的運輸、glycosilation、protein quality control等等
SER：儲存鈣離子、合成性激素、解毒(肝細胞)
(3) Golgi apparatus：蛋白質修飾，送到各自的目標
→是個由許多disk shape構成的膜狀結構
→Cis Golgi network→cis cisternae→medial cisternnae→trans cisternae→TGN
(4) Lysosome：溶酶體
→裝有許多水解酵素，能夠與其他的膜狀結構fuse，進行分解
→小分子能夠直接進入lysosome；較大的物質如mit，則先由ER的膜包住形成autophagosome vacuole，最後與lysosome fuse而分解；易有部份的物質，是藉由chaperone的協助送入lysosome中
→lysosome的酵素缺失會造成很嚴重的疾病，ppt上提到Tay-Sachs disease就是缺少了β-hexosaminidase，因此造成ganglioside在神經系統中的堆積，造成嚴重的傷害。
(5) Mitochondria
→ATP的製造場所，細胞的發電廠
→同時會製造出自由基(ROS)，需要有一系列的酵素處理
→在細胞自殺(apoptosis)中扮演重要角色
(6) Peroxisome
→解毒，消除自由基(肝臟細胞多)
→分解長鏈的脂肪(較短的則在mit進行β oxidation)
(7) Cytoskeleton
a. actin filament：微絲
→由actin蛋白所組成，組成微絲
→具有(+)(-)兩端(polarity)，與細胞的形狀與運動有關
b. intermediate filament：中間絲
→其基本架構為四條protein組成的tetramer，不具polarity
→能夠固定胞器的位置，在細胞junction也扮演重要角色
c. microtubule：微管
→由α，β兩種tubulin組成的，形成一個管狀結構，具有polarity
→MAP(microtubule associated protein)能夠穩固microtubule得結構
→motor protein：kinesin(往正端移動)，dynein(往負端移動)，消耗能量產生運動！
→microtubule有個dynamic instability，意指microtubule的plus end可以組裝或分解tubulin，讓microtubule的長度發生改變(消耗GTP)
→microtubule構成cilia，flagella，mitotic spindle等構造
→Microtubule organizing center (MTOCs)，為特化的結構，為microtubule聚合的起始點，常見的例子為centrosome
(8) cytoplasmic inclusions：為一些暫存的構造，並不出現在每個cell
→ex. glycosome能夠儲存glycogen(肝醣)，lipid droplet
三‧nucleus、DNA、cell cycle
(1) nucleus細胞核
→是否具有核膜(nuclear envelope)為區分真核原核的基準
→由核膜(上有核孔，對小分子不具選擇性通透)，核仁(nucleolus，合成rRNA的subunit)，核質(染色質的位置)等結構所組成
→chromatin(染色質)，依照其摺疊的緊密程度分為condensed與extended，較緊密者，則該段基因較不易表現，藉由改變緊密程度能夠控制特定protein的表現量。有些regulatory protein即能影響(zinc finger結構)，或是對histone protein做共價修飾(ex.甲基化、acetylation)
(2) DNA
→細胞核中的DNA若延展開來，約有1.8m長！因此需要很多層次的摺疊
→最基本的就是由histone protein的『nucleosome』核小體，組成所謂『beads on a string』得結構
→接著還有所謂的30nm fiber，supercoiled等等結構，讓超長的DNA能夠容納於細胞核
→histone的共價性修飾能夠改變gene的表現情況，若甲基化則抑制，acetylation則會活化基因
(3) 細胞生命週期(life cycle)
→細胞的周期可以先分成mitotic phase與interphase
→interphase又可分成G1期，S期(DNA複製)，G2期
→M期又可分成prophase，metaphase，anaphase，telophase
a. Prophase：染色質濃縮成染色體，中心體移到兩側，spindle形成
b. metaphase：DNA排列在赤道板
c. anaphase：DNA從赤道板往兩側移動
d. telophase：完成DNA的移動，染色體拆開，核膜逐漸形成
→cytolinesis：細胞質分裂，細胞分裂成兩個子細胞！！
→這裡有很多細節，可以在回去翻胞生，像是checkpoint的概念，cdk與cyclin的功能
→tumor為一群cell cycle不受控制的細胞，可能是兩種類型的gene壞掉
→protooncogene：為一群促進細胞分裂的gene，如果壞掉、或是過度表現，可能會加速細胞分裂
→tumor suppressor gene：為一群抑制細胞分裂的gene，如果壞掉了，會讓細胞分裂不受抑制
→通常癌症都是要有許多的gene壞掉，才會產生
(4) Apoptosis細胞自殺
→programmed cell death (ex.手指間的蹼狀物消失，蝌蚪的尾巴)
→相對的概念是necrosis，細胞因為外力或其他因素死亡，會破裂釋放出細胞的物質，導致發炎反應的產生
→apoptosis的發生可能來自於兩種途徑，intrinsic與extrinsic兩種
→intrinsic的機制來自於細胞的壓力(stress，例如自由基、DNA損壞)，會促此mit中的cytocrome C釋放，與細胞中的procaspase組成apoptosome，進行切割，促使apoptosis的進行
→extrinsic的機制則來自於胞外的訊號(ex. T cell)，訊號會與膜上的ligand結合，促進下游蛋白質的活化，最後導致apoptosis的產生
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