1. response to internal and external stimuli：
a. stimuli：hormone，miRNA，外界環境改變
b. response：receptor----messenger-----effector
c. messenger：鈣離子相當的重要
d. effector：直接影響細胞反應，例如CDPK(calcium-dependent kinase)
2. plant hormone
a. auxin：
(1) 運輸：cell to cell：AUX1(auxin influx carrier)與PIN protein(auxin efflux carrier)。
(2) 與apical-basal polarity相關：往下的PIN較多，故生長激素往下移動為主
(3) 促進細胞延展(酸性生長假說)
(4) 注意auxin相關的實驗內容
b. cytokinin(CK)：在xylem運輸
(1) 刺激細胞分裂
(2) 與IAA共同影響callus的分化
過程：先加入1比1的IAA和CK，植物細胞成為callus，接著若加入IAA,CK比大於10，分化成根；反之則分化成shoot
c. gibberellin(GA)：
(1) 刺激細胞的分裂
(2) 阻斷DELLA protein的作用(類似踩煞車的功能)
d. ethylene：(C2H2)
(1) abcisison的產生
(2) 水果的成熟(ripening)：為positive feedback；二氧化碳可以inhibit乙烯的合成
(3) “triple response”：種子萌芽後會產生hook，防止頂芽受損
Mechanism：乙烯阻止芽與根的延長，進而產生彎曲的結構
e. abscisic acid(ABA)：
(1) 為逆境激素
(2) 在缺水條件下，關閉stomata
(3) 種子的休眠，阻止種子在不適當的時機發芽
f. brassinosteroid：
(1) 促進液胞吸水，造成細胞的延展
(2) 促進xylem的發育
3. light receptor：
a. 藍光受器：
(1)cryptochrome：徒長黃化現象
在光照不足的條件下，幼苗分泌COP1，阻礙chlorophyll的合成，產生徒長黃化的現象。直到遭遇光照環境，COP1與cryptochrome結合，使得COP1失去活性
(2)phototropin：影響植物的向光性
b. Red/far-red：phytochrome(光敏素)
(1) 有兩種型式：pr以及pfr兩種
(2) Pr為inactive form；pfr為active form
(3) 影響幼苗的發育，促進植物的生長
(4) Shading response：當頂端的葉片遮住下方的葉片，被遮住的葉片，多為pr狀態，刺激internode frowth
4. tropism：
a. thigmotropism：向觸性
主要是葉枕(pulvini)的改變
碰觸後，離子通道打開，離子湧出細胞，間接造成水分離開細胞，最後葉片下垂。
b. gravitropism：向地性
statocyte(特化的gravity-sensing細胞)，其中的statolith(starch-heavy plastid)因受重力影響而下沉，造成鈣離子濃度的改變，影響auxin transport
5. response to adversity：
a. excessive light：利用胡蘿蔔素，葉黃素保護D1 protein
b. flooding：aerenchyma(通氣組織)，ethylene，apoptosis
c. drought：regulate aquporin；close stromata(ABA)
d. heat：heat shock protein
e. cold：vernalization(春化作用)，biennial經過低溫後，隔年開花
f. herbivore：chemical defence；分泌分子吸引insect attackers的天敵
g. pathogen：
過程：pathogen分泌elicitor，產生virulence
植物防禦：R gene，為elicitor的受體
(1) HR：hypersensitive response：
產生過氧化氫以及NO，促進鄰近細胞死亡(necrotic spot)，或產生tough ligin，並產生alarm signals(salicylic acid柳酸)
(2) SAR：systemic acquired resistance：
Pathogen attack---systemin----salicylic：甲基化後散布於空氣
-----Jasmonic acid：transport to plants allover
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